Điểm nổi bật của Thương Hàn Luận Thuật Nghĩa nằm ở phương pháp nghiên cứu chú trọng bản chất bệnh chứng, cơ chế phát sinh bệnh và mối quan hệ giữa biện chứng với phép điều trị. Thay vì chỉ giải thích câu chữ hoặc tập hợp các phương thuốc, Đan Ba Nguyên Kiên đi sâu khảo sát ý nghĩa của từng học thuyết, đối chiếu những quan điểm chú giải khác nhau, đồng thời đưa ra nhận định nhằm làm rõ những vấn đề còn tồn tại trong cách hiểu Thương Hàn Luận.
Nội dung tác phẩm bao quát nhiều vấn đề quan trọng trong hệ thống lý luận thương hàn, đặc biệt là sự phân loại và nhận diện bệnh chứng theo lục kinh, bao gồm Thái dương, Dương minh, Thiếu dương, Thái âm, Thiếu âm và Quyết âm. Thông qua việc phân tích các biểu hiện hàn, nhiệt, hư, thực cùng sự biến hóa của bệnh tà, tác giả làm rõ quá trình hình thành, phát triển và chuyển biến của bệnh, qua đó giải thích cơ sở lý luận của việc lựa chọn phương pháp điều trị.
Bên cạnh hệ thống lục kinh, tác phẩm còn nghiên cứu các vấn đề như hợp bệnh, tịnh bệnh, ôn bệnh, phong ôn, phong thấp, huyết nhiệt, ứ huyết, nhiệt nhập huyết thất và những chứng bệnh phát sinh do điều trị không phù hợp. Các nội dung được trình bày trong mối liên hệ giữa triệu chứng, mạch tượng, bệnh cơ và phép trị, thể hiện cách tiếp cận có hệ thống đối với những vấn đề phức tạp của y học cổ truyền.
Một giá trị đáng chú ý khác của Thương Hàn Luận Thuật Nghĩa là tinh thần khảo chứng và tư duy phản biện của tác giả. Đan Ba Nguyên Kiên không hoàn toàn tiếp nhận những lời chú giải có trước mà thường xuyên xem xét, so sánh và phân biệt các cách lý giải, từ đó tìm kiếm cách hiểu phù hợp với ý nghĩa của kinh văn và thực tiễn chẩn trị.
Đối với người nghiên cứu Đông y, sinh viên y học cổ truyền và những độc giả quan tâm đến lịch sử y học phương Đông, Luận giải ý nghĩa của sách Thương Hàn Luận là nguồn tư liệu có giá trị để tìm hiểu sâu hơn về tư tưởng y học của Trương Trọng Cảnh, đồng thời khám phá truyền thống nghiên cứu Thương Hàn Luận của các y gia Nhật Bản thời Edo.
Đề từ
Quyển 1
Tự thuật
Tổng thuật về âm dương
Quyển 2
Thuật bệnh Thái dương
Thuật bệnh Dương minh
Thuật bệnh Thái âm
Thuật bệnh Thiếu âm
Luận về bệnh Quyết âm
Quyển ba
Luận về hợp bệnh và bệnh đồng thời
Luận về ôn bệnh và phong ôn
Quyển bốn
Luận về hoại bệnh
Luận về các chứng kiêm biến
Hư phạp
Nhiệt uất
Ẩm tà giao kết mà tụ
Ẩm tà cùng kết
Huyết nhiệt, ứ huyết
Nhiệt nhập huyết thất
Phong thấp
Thấp nhiệt, hàn thấp
Quyển năm
Thuật về Hoắc loạn
Thuật về bệnh khỏi rồi lao phục
(Chứng âm dương dịch không có nghĩa gì để thuật, nên không chép rườm.)
(Phụ) Vấn đáp
Bổ di của Thương hàn luận thuật nghĩa
Bạt





